Kun virus on siirretty, on vaihe, jossa tartunnan saaneella ei ole merkkejä. Tätä kutsutaan vaiheeksi hiljainenja jälkimmäinen kestää 2–21 päivää. Tänä aikana virusta on mahdotonta havaita verestä, koska se on liian alhainen, eikä henkilöä voida hoitaa.

Sitten ilmestyvät ensimmäiset Ebola -viruksen oireet. Viisi ilmeisimpiä oireita ovat:

• Äkillinen voimakas kuume, johon liittyy vilunväristyksiä;
• Ripuli;
• Oksentelu;
• Erittäin voimakas väsymys;
• Merkittävä ruokahaluttomuus (anoreksia).

Muita merkkejä voi esiintyä:

• päänsärky;
• lihassäryt;
• nivelkipu;
• heikkoudet;
• kurkun ärsytys;
• vatsakipu;

Ja pahenemisen tapauksessa:

• yskä;
• ihottuma;
• rintakipu;
• Punaiset silmät;
• munuaisten ja maksan vajaatoiminta;
• sisäiset ja ulkoiset verenvuodot.